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薬剤の有効性に関与する遺伝子多型の検出

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Takashi Kikuchi
Takashi Kikuchi on 20 Dec 2017
Answered: Takafumi on 24 Dec 2017
一塩基多型(single nucleotide polymorphism)のデータを用いて、ある抗がん剤の有効性に関与する遺伝子を検出したいのですが、Matlabによってどのような解析をすればよいでしょうか?

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Takafumi
Takafumi on 24 Dec 2017
通常のSNP 解析は、ご存知だと思いますが、一つのツールで完結することはできないので、
様々なツールと組み合わせて、解析する必要があります。 MATLABで出来ることは、統計処理など限られた範囲になります。
NGSを使うという前提であれば、下の例題が参考になるかと思います。
公共データ・ベースなどからの、アノテーション情報を取り込む方法などが書いています。

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Tohru Kikawada
Tohru Kikawada on 22 Dec 2017
この分野の知見がないのですが Bioinformatics Toolbox バリアント解析の手法 をいくつかサポートしているようです。ご参考になれば幸いです。

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