こんにちは。
プロットした線はグラフィックスオブジェクトとして、変数に保存することができます。
複数のプロットをいったん保存してあとで一つずつ表示しなおすサンプルを次のように作りました。参考にしていただければと思います。注意点としては、linesに保存した各プロットライン情報は、それを表示している元のfigureを閉じた段階で消滅します。気を付けてください。
close, clear, clc;
figure;
hold on;
x = [0:0.01:1];
for i = 1:5
lines(i) = {plot(x,sin(2*pi*i*x))};
end
figure
pnew = line();
for i = 1:5
set(pnew,'XData',lines{i}.XData,'YData',lines{i}.YData);
pause(0.5);
end